RNA干涉的詞匯解釋
RNA干涉的詞匯解釋
RNA干涉是在演化中保留下來的一個(gè)過程,通過該過程,雙鏈RNA誘導(dǎo)目標(biāo)基因沉默。接下來小編為大家整理RNA干涉的詞匯解釋,希望對(duì)你有幫助哦!
Slicer:在切割型RISC中的內(nèi)切酶的另外一種表述方法。
Microprocessor:一種核內(nèi)的復(fù)合物,主要由Drosha和Pasha兩者組成,在miRNA的生物合成中促使原始的miRNA成為miRNA前體。
MicroRNA (miRNA):是含有莖環(huán)結(jié)構(gòu)的miRNA前體,經(jīng)過Dicer加工之后的一類非編碼的小RNA分子(~21-23個(gè)核苷酸)。MiRNA,以及 miRISCs(RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物)在動(dòng)物和植物中廣泛表達(dá)。因之具有破壞目標(biāo)特異性基因的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物或者誘導(dǎo)翻譯抑制的功能,miRNA被認(rèn)為在調(diào)控發(fā)育過程中有重要作用。
Argonaute (AGO):一類龐大的蛋白質(zhì)家族,是組成RISCs復(fù)合物的主要成員。AGO蛋白質(zhì)主要包含兩個(gè)結(jié)構(gòu)域:PAZ和PIWI兩個(gè)結(jié)構(gòu)域,但具體功能現(xiàn)在尚不清楚。最近的研究表明,PAZ結(jié)構(gòu)域結(jié)合到siRNA 的3'的二核苷酸突出端;一些AGO蛋白質(zhì)的PIWI結(jié)構(gòu)域賦予slicer以內(nèi)切酶的活性。PAZ和PIWI兩個(gè)結(jié)構(gòu)域,對(duì)于siRNA和目標(biāo)mRNA 相互作用,從而導(dǎo)致目標(biāo)mRNA的切割或者翻譯抑制過程,是必不可少的。同時(shí),不同的AGO蛋白質(zhì)有著不同的生物學(xué)功能。例如,在人當(dāng)中,AGO2“籌劃”了RISCs對(duì)于目標(biāo)mRNA的切割過程;而AGO1 和AGO3則不具備這個(gè)功能。
Core RISC:是介導(dǎo)目標(biāo)mRNA切割過程或者翻譯抑制的最小的RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物。在人和果蠅身上發(fā)現(xiàn)的分子量少于200kDa的RISCs可能就是core RISC的重要代表。AGO蛋白質(zhì)和Core RISC密切相關(guān)。
Dicer (DCR):是RNAase Ⅲ家族中的一員,主要切割dsRNA或者莖環(huán)結(jié)構(gòu)的RNA前體成為小RNAs分子。對(duì)應(yīng)地,我們將這種小RNAs分子命名為siRNAs和miRNA. Dicer有著較多的結(jié)構(gòu)域,最先在果蠅中發(fā)現(xiàn),并且在不同的生物體上表現(xiàn)出很高的保守性。
Holo RISC:是在果蠅中發(fā)現(xiàn)的有著RISC活性的最大的RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物(80S)。Holo RISC的生物學(xué)活性牽涉到幾乎所有的RISC的成員,RLC成員,和一些其他通路上的蛋白質(zhì)分子。Holo RISC的存在,表明了RISC組裝不是孤立的,同時(shí)還是一個(gè)有序的過程。以RISC為中心的RNAi和miRNA通路與一些其他的通路密切聯(lián)系,很可能借此調(diào)控生物體的生長(zhǎng)發(fā)育過程。
RISC loading complex (RLC):是一種促使RISC形成的復(fù)合物。RLC有方向性地調(diào)節(jié)小RNA雙螺旋,為以后的RISC組裝作好鋪墊。最近,siRISC loading complexes (siRLCs)在果蠅中研究最多。有研究者認(rèn)為在果蠅中的siRLCs包含DCR2-R2D2異型二聚體和siRNA雙螺旋;R2D2部分是非對(duì)稱性的感受器,為RISC組裝調(diào)整好siRNA的方向。miRISC loading complexes (miRISCs)的研究尚未報(bào)導(dǎo),因?yàn)樗倪^程更為復(fù)雜,而且體外研究miRLCs的方法還沒有建立。
RNA-induced initiation of transcriptional gene silencing (RITS):是一種組織染色質(zhì)變型的復(fù)合物。RITS復(fù)合物也包含Dicer加工形成的siRNA和AGO蛋白質(zhì),通過結(jié)合到異染色質(zhì)的基因池上來促使異染色質(zhì)上基因的沉默。
RNA-induced silencing complex (RISC):一種RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物,通過與目標(biāo)mRNA完全或者部分的互補(bǔ)配對(duì)來實(shí)施切割或者翻譯抑制功能。SiRNA組裝siRISC, miRNA組裝miRISC.RISCs(無論siRISC還是miRISC)包括兩種類型:切割型和不切割型?,F(xiàn)在的研究表明,RISC當(dāng)中的AGO蛋白質(zhì)決定了RISC是切割型的還是不切割型的。
Small interfering RNA (siRNA):是一種小RNA分子(~21-25核苷酸),由Dicer(RNAase Ⅲ家族中對(duì)雙鏈RNA具有特異性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成員,激發(fā)與之互補(bǔ)的目標(biāo)mRNA的沉默。